芥子泥对皮肤有刺激作用，可引起皮肤潮红、疼痛、充血等，时间稍久则产生水泡，其刺激作用与芥子甙水解产生异硫氰酸烯丙酯（挥发性油）有关。
内服可作刺激性祛痰药，并治疗腹痛，过量可致胃肠道炎症。
1：3水浸剂试管稀释法，对堇色毛癣菌、许兰黄癣菌等有抑制作用。