关黄柏主要含小檗碱约1.6%,尚含掌叶防己碱、黄柏碱、药根碱、黄柏酮、蝙蝠葛任碱、白栝楼碱、木兰碱、柠檬苦素等。
根皮分离出小檗碱约9%,尚含药根碱、黄柏碱、白栝楼碱。
川黄柏小檗碱含量较高,达3%。